Главная причина - это разный возраст этих гор.
Алтай - горы молодые, они продолжают расти в результате движения литосферных плит.
Уральские горы - гораздо старше, рост прекратился миллионы лет назад. Сейчас они продолжают разрушаться под воздействием перепадов температур, ветра, текучей воды в реках, дождей, поэтому высота Урала продолжает уменьшаться.