Содержание диссертации, кандидата физико-математических наук, Баранов, Владимир Иванович
ВВЕДЕНИЕ.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ. Структурно-функциональные свойства рибосом.9.
Введение
Глава I. Структура рибосом.
1.1. Структура рибосомных белков и РНК
1.2. Четвертичная структура рибосом
1.3. Функциональные центры рибосом.
1.4. Резюме.2.
Глава 2. Структурная лабильность рибосом
2.1. Ассоциация - диссоциация рибосом
2.2. Структурная лабильность рибосомных субчастиц
2.3. Резюме
Глава 3. Функционирование рибосом
3.1. Основные компоненты системы трансляции
3.2. Связывание аминоацил-тРНК
3.3. Образование пептидной связи (транспептидация)
3.4. Транслокация.
3.5. Резюме.
Глава 4. Динамика транслирующих рибосом
4.1. Динамические модели транслирующих рибосом и их экспериментальная проверка.
4.2. Роль факторов элонгации и ®0Р в процессе трансляции.
4.3. Резюме.
Глава 5. Постановка задачи и выбор методов исследования
5.1. Постановка задачи.
5.2. Выбор методов исследования.
5.2.1. Твердофазная система трансляции
5.2.2. Электронная микроскопия
5.2.3. Сравнительный седиментационный анализ
5.2.4. Методы диффузного рентгеновского и нейтронного рассеяния.
5.3. Резюме.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.
Материалы и методы.
1. Выращивание бактериальной массы
2. Выделение и хранение рибосом.
3. Выделение тотальной ферментной фракции
4. Выделение препарата суммарной тРНК
5. Аминоацилирование суммарной тРНК фенилаланином
6. Получение фрашентированной поли (У) длиной 110-140 нуклеотидов с окисленным периодатом
З^концом.
7. Получение поли(У), ковалентно связанной с твердым носителем (сефарозой) за ¿конец через расщепляемый з-Б-мостик.(Сефароза-8-Бчюли(У))
8. Подбор оптимальных соотношений компонентов трансляции на свободной поли (У)
9. Получение пре-транслокационных и пост-транслокационных состояний транслирующих рибосом с помощью колонок, содержащих иммобилизованную полиуридиловую кислоту.
10. Тестирование функциональных состояний пре-транслокационных и пост-транслокационных рибосом.
11. Электронная микроскопия транслирующих рибосом
12. Сравнительный седиментационный анализ
13. Малоугловое диффузное рассеяние нейтронов (метод вариации контраста в нейтронном рассеянии).
14. Малоутловое диффузное рентгеновское рассеяние
15. Материалы