Была ли эффективна организация труда в военных поселениях

Нет, не могла.
Людям приходилось одновременно нести воинскую службу и заниматься сельским хозяйством. Совмещение столько разных дел не могло дать хорошего результата, насколько бы эффективна организация труда не была.