Истории о происхождении чихуахуа крайне противоречивы,- по одной теории самую маленькую породу собак чихуахуа подарила миру древняя земля ацтеков, по другой- происхождение породы связывается с развитием древних индейских племен тольтеков и цивилизацией майя, по третьей – родиной чихуахуа является Египет, также рассматриваются теории связанные с Китаем, Японией, островом Мальта и даже космическим происхождением чихуахуа.
Так или иначе, история чихуахуа уходит своими корнями в далекую древность. Существует мнение, что похожие на чихуахуа собаки появились примерно в третьем тысячелетии до нашей эры на территории современной Мексики. Подтверждением тому являются многочисленные глиняные статуэтки и настенные рисунки чихуахуа найденные археологами в мексиканских храмах, рисунки чихуахуа на древних сосудах, извлеченных из гробниц. При проведении раскопок древних захоронений были найдены маленькие собачьи скелеты, с характерным родничком на черепе, на которых были ошейники с драгоценными камнями.

Название породы произошло от одноименной провинции на севере Мексики, где впервые были обнаружены современные чихуахуа. Иногда эту породу называют ши-ва-ва (английское произношение слова чихуахуа), но общепринятым является - чихуахуа.
Древнее предназначение чихуахуа для человека тоже противоречиво, по одной легенде чихуахуа как и других маленьких собачек откармливали в пищу, по другой – чихуахуа было священным животным, несколько столетий подряд крошка чихуахуа являлась своеобразным талисманом богатых людей.

Серебристо-голубых чихуахуа разводили жрецы ацтеков, чихуахуа такого редкого окраса считались священными животными: ни один человек, даже самый богатый и знатный, не имел права приближаться к священной голубой собаке. Серебристо-голубая чихуахуа была хранительницей Голубого камня индейцев.
Как бы то ни было, статусом самостоятельной породы чихуахуа обязаны США. Первый американский клуб образовался в 1923 году, в 1949 году образован клуб любителей чихуахуа в Англии. С тех пор чихуахуа сыскали поистине бешеную популярность в Европе. В 1884 году на выставке собак в Филадельфии впервые была представлена чихуахуа, в 1904 году была внесена в племенной регистр чихуахуа по кличке Миджет. В 1954 году был принят англо-американский стандарт породы чихуахуа. С 1956 года в породе стали различать две самостоятельные разновидности чихуахуа: длинношерстную и короткошерстную.
Сейчас чихуахуа можно встретить практически во всех странах мира, но наиболее любима она в Латинской Америке, США, Канаде и Англии. Мексиканцы считают чихуахуа своей национальной породой.

В шестидесятых годах прошлого столетия чихуахуа появились в Москве, в 1996 году образовался первый московский национальный клуб чихуахуа (чихуахуэньо).
В настоящее время в связи с появившимися возможностями завоза собак в Москву из-за рубежа энтузиастами породы было привезено довольно большое количество новых собак как длинношерстных, так и гладкошерстных из Чехии, Югославии, Венгрии, Германии, Франции, Голландии, Италии, Австрии, а также Мексики, США, Англии.
Сегодня чихуахуа по праву входит в число 20 наиболее популярных пород собак в мире.