Критерий положения. Гомологичными считаются части, занимающие сходное положение относительно других частей тела.
Критерий специального качества. Гомологичными могут считаться только те структуры, которые сходны между собой по тонкому строению.
Критерий переходных форм. Если две формы не сходны друг с другом, но связаны непрерывным рядом «переходных форм», то их можно считать гомологичными.
Критерий состава. Гомологичными считаются органы, состоящие из сходных и сходным образом расположенных относительно друг друга частей. Этот критерий в сущности совпадает со вторым критерием.
Критерий развития. Гомологичными считаются органы, сходным образом развивающиеся из одинаковых эмбриональных зачатков.
Генетический критерий. Гомологичными считаются структуры, в основе развития которых лежит одна и та же генетическая программа (система взаимодействующих генов), унаследованная от общих предков.