Эвглена зеленая относится к жгутиковым (простейшим). По типу питания некоторые эвгленовые, в т.ч. и эвглена зеленая, являются миксотрофами (т.е. способны использовать разные источники углерода и энергии). Часть органических веществ эвглена зеленая получает с помощью фотосинтеза; кроме того, они способны питаться, как и остальные простейшие, заглатывая кусочки органической пищи. В дальнейшем эта пища переваривается в пищеварительной вакуоли.