Моллюски входят в цепи питания многих животных и птиц. Сухопутными моллюсками питаются птицы, кроты, а водными рыбы. Головоногие моллюски (кальмары, осьминоги) служат пищей для более крупных животных, тюленей, кашалотов.
Двустворчатые являются фильтрами для очистки воды, их даже специально выращивают (устрицы).
Некоторые являются промежуточным хозяином для паразитических червей (например прудовик для печеночного сосальщика).
Для человека много моллюсков служат пищей (устрицы, морские гребешки, виноградные улитки). Жемчужницы идут на изготовление перламутровых украшений и фурнитуры, на сбор жемчуга. Измельченные раковины некоторых добавляют в корм курам (беззубки).
Также моллюски и наносят вред: корабельный червь портит лодки и сооружения, голые слизни вредят растениям, рапана уничтожает мидий, дрейссена портит гидротехнические сооружения. Некоторые раковины моллюсков используют в качестве источника кальция в фармакологии.