В отличие от бесчерепных у позвоночных движение крови связано с деятельностью сердца.
В отличие от других хордовых — оболочников и позвоночных, бесчерепные сохраняют основные признаки типа (хорда, нервная трубка и жаберные щели) в течение всей жизни. Головной отдел тела не обособлен, нервная трубка не делится на головной и спинной мозг, череп отсутствует (отсюда название).