Я считаю, что есть несколько факторов.
Например, экономический. Если река удобна для строительства ГЭС, но рядом отсутствует крупные потребители энергии, зачем она нужна?
Так же фактор экологический. При строительстве может измениться ареал обитания различных видов.
На каких реках нельзя строить ГЭС:
Обь, Лена, Амур, Иртыш, Москва.
На каких можно:
Вилюй, Ангара, Енисей, Урал, Тунгуска