Некоторые виды дрожжей являются факультативными и условнымипатогенами, вызывая заболевания у людей с ослабленной иммунной системой.
Дрожжи рода Candida являются компонентами нормальной микрофлоры человека, однако при общем ослаблении организма травмами, ожогами, хирургическим вмешательством, длительном применении антибиотиков, в раннем детском возрасте и в старостии т. д. грибы рода Candida могут массово развиваться, вызывая заболевание —кандидоз. Существуют различныештаммы этого гриба, в том числе достаточно опасные. В нормальных условиях в человеческом организме дрожжи рода Candida ограничиваются в своём развитии естественной бактериальной микрофлорой человека (лактобактерии и пр.), но при развитии патологического процесса многие из них образуют высокопатогенные сообщества с бактериями.
Cryptococcus neoformans вызываеткриптококкоз, особенно опасный для ВИЧ-инфицированных людей: среди них заболеваемость криптококкозом достигает 7—8 % в США и 3—6 % вЗападной Европе. Клетки C. neoformansокружены прочной полисахариднойкапсулой, которая препятствует их распознаванию и уничтожениюлейкоцитами. Дрожжи этого вида наиболее часто обнаруживаются в помётептиц, при том что сами птицы не болеют.
Род Malassezia включает облигатныхсимбионтов теплокровных животных и человека, не встречающихся нигде, кроме их кожных покровов. При нарушениях иммунитета вызывают питириаз (пёстрый лишай), фолликулит и себорейный дерматит. У здоровых людей при нормальном функционировании сальных желез Malassezia никак себя не проявляют и даже играют положительную роль, препятствуя развитию более опасных патогенов.