1. Клетка-организм обычно выполняет все функции данного организма. А отдельная клетка в многоклеточном организме строго дифференцирована и выполняет определённую функцию.
2. Клетка одноклеточного организма. как правило, сложнее устрена, чем многоклеточного.
3. Клетка одноклеточного организма, как правило имеет реснички, жгутики или псевдоподии для передвижения, а клетка многоклеточного чаще этих структур не имеет.