С течением времени одни слова уходят из языка, другие меняют свои первоначальные значения. В результате рвутся родственные связи, изменяются границы между морфемами, и слова, когда-то однокоренные, перестают восприниматься как родственные.
Какие слова восходят к одному корню?
атом
пятитомник
утомиться
потомок
анатомия