Я фильм Андрей Рублев раза три смотрел и совершенно не представляю о чем этот вопрос. Если попытаться припомнить - там было несколько коллизий:
1. По приказу князя ослепили зодчих, что создали для князя уникальный собор. Это сделали, что бы у другого князя не было такого собора.
2. Задержали княжеские слуги шута-скомороха, что высмеивал порядки в кабаке.
3. Разгром города и монастыря во время татарского набега.
Андрею Рублеву не нравилось все это. После татарского набега он принял обет молчания лет на двадцать. А так, что работал, расписывал соборы, осуждал, но продолжал работать. И вообще, надо понимать, что фильм этот не про Россию 15 века, а про Москву середины 60-х годов. И в кино- Рублеве надо видеть не средневекового монаха, а Тарковского и его время, его окружение.