Все реки Дмитровского района принадлежат к бассейну Волги. Одни, как например, река Дубна, прямо впадают в Волгу, а другие, такие как река Яхрома или Веля, сначала впадают в более крупные притоки Волги. Большинство рек текут на север, прорезая Клинско-Дмитровскую возвышенность.
Река Яхрома.
Самая значительная река на территории Дмитровского района - река Яхрома, ее длина 101 км. Она впадает в Сестру, Сестра - в реку Дубну, а Дубна - в Волгу. Когда-то, в очень далекие времена, река Яхрома была судоходной, но с течением времени, а особенно после строительства канал им. Москвы - обмелела. Как единая река перестала существовать, и теперь есть как бы две реки Яхромы: верхняя, до канала, и нижняя после пересечения ее с каналом.
Истоки реки Яхромы находятся в Пушкинском районе. В среднем течение (с юга на север) принимает сточные воды промышленных предприятий, потому была изолирована от канала им. Москвы и пропущена по трубам под ложем канала. У Дмитрова река Яхрома выходит на низменность, поворачивая на северо-запад, где от нее отведены оросительные каналы. Этот участок речной долины интенсивно возделывается и занят посадками картофеля, моркови, капусты. Основное русло Яхромы имеет здесь ширину 18 м и глубину до 2,2 м. Самый крупный приток реки Яхрома - Волгуша. Долина реки Волгуша - одно из самых живописнейших мест Дмитровского района.
По северной границе Дмитровского и Талдомского районов проходит в своем среднем течении приток Волги - река Дубна. Это крупная река ее длина 158 километров. На своем пути она делает несколько поворотов.
Пойма Дубны – один из наиболее живописных и богатых уголков природы Подмосковья. Здесь в труднопроходимых зарослях кустарников и низкорослых березняках, кочковатых осоковых болотах водится много охотничьей дичи и птиц: кабаны, лоси, утки, бекасы, глухари, а также журавли и другие птицы. Еще в пятидесятых годах нередки были волки, раньше водились медведи.
Река Дубна.
По границе с Сергиев-Посадским районом самый крупный приток Дубны - река Веля. Начинаясь недалеко от Сергиева Посада, она течет на запад в узкой, хорошо оформленной долине, рассекая Клинско-Дмитровскую гряду, и впадает в Дубну севернее села Ольявидово.
Течение другого притока реки Дубны - Якоти - целиком приходится на Дмитровский район. Река Якоть начинается у деревни Плетнево и тоже течет сначала на запад, затем поворачивает на север и впадает в реку Дубну у Вербилок. Большая ее часть проходит по заболоченной низменности.
В Дмитровском районе озер немного. К северу от Дмитрова, у деревни Очева, находится озеро Введенское, к востоку озеро Свинское (Свиное) между селом Костино и деревней Щетнево. На границе Дмитровского и Мытищинского районов расположены рядом еще три озера ледникового происхождения: озеро Нерское - около села Озерецкое справа от шоссе Рогачево-Лобня, озера Долгое и озеро Круглое слева от этого шоссе.
Необходимо не забывать про обилие прудов в Дмитровском районе. Почти в каждой деревне всегда существовало по нескольку прудов.
Значительную роль в изменение географии водоемов Дмитровского района сыграл канал им. Москвы. Он стал важным водно-транспортным путем, имеет важное значение для водоснабжения и энергоснабжения Москвы. Для этих целей землянными плотинами, вытянутыми по долинам рек, вдоль канала созданы водохранилища.
Первое из них, на территории нашего района - Икшинское водохранилище - образовалось благодаря подпору речки Икши земляной плотиной у деревни Пчелки. Ближе к Москве располагается еще несколько водохранилищ: Пестовское у дер. Пестово, Пяловское на речке Уче, Акуловское, Учинское, Клязьмиское и Химкинское.