Река Лена рыба продуктивность водоемов определяется состоянием запасов доминирующих видов рыб, для Лены ими являются омуль, муксун и ряпушка. всего в бассейне реки обитают 37 видов рыб.
Сибирский осетр малотипичный вид имеет речные и озерно-речные формы, заселяет участок Лены от села Коршукова (ниже Керенска) до приморья пищей осетру служат организмы бентоса и рыбы (елец, плотва) . Осетр не совершает больших кормовых и нерестовых миграций.
Таймень в бассейне в самой реке Лене распространен от верховья до дельты включительно. Таймень типичный хищник промысловые скопления образуют только в нерестовый период и во время ската с нерестилищ.
Ленок в бассейне реки Лена встречается в верхнем и среднем течении, редок в нижнем, предустьевом отрезке реки Лена и никогда не выходит в приморские участки. Размножение в бассейне реки Лена приходится на начало июня.
Нельма Ленская популяция нельмы растет и нагуливается на шельфе в опресненных морских прибрежных районах в дельте реки, в нижнем и среднем ее течении. По реке она поднимается очень высоко, ее нерестилище известны в реках Витиме, Алдане, Олекме и, по видимому в реке Нюе, где она нередко ловится. Крупное нерестилище в реке Вилюй уничтожено в результате в строительстве каскада ГЭС. Путь к нерестилищам отдельных стай рыб составляет свыше 3-х тысяч километров. Из всех водоемов Якутии только в реке Лена популяция нельмы находится в удовлетворительном состоянии. Но и в Лене запасы нельмы незначительны и оптимальной мерой по увеличению численности Ленской популяции вида следует признать ее искусственного разведения.
Тугун в пределах Лены распространен от реки Иул до дельтовых участков. Наиболее плотно заселяет течение реки Лены от Витима до Сорока Островов и притоки Чую, Витим. Олекма, Алдан, Вилюй, здесь он живет постоянно, размножается и имеет промысловое значение.
Муксун один из основных промысловых видов. В дельте Лены проявляют 4 расы муксуна. Полупроходной мало тычинковый осваивает нижние участки проток дельты. Летом, когда соленые морские воды разбавляются пресной Ленской водой, распределяется преимущественно в авандельте и мелководьям вдоль морского побережья. В дельте преобладает в маловодных протоках в северо-западной части дельты, В пищевом комке круглогодично превалируют организмы зообентоса. Полупроходной много тычинковый муксун наиболее многочислен в низовьях многоводных проток. В спектре питания основополагающими являются организмы зоопланктона и зообентоса, но встречаются и рыбы. Дельтовый муксун населяет все протоки дельты, в периоды значительного стока реки выходит в опресненную зону. По характеру питания эврифаг, основу кормового питания составляют мизиды. Ту водный муксун населяет главным образом верхний и средний участки дельты, реже встречаются на нижних участках проток дельты. Основу рациона составляет бентос в спектре питания обычны детрит и насекомые. Научно-исследовательские работы в нижнем течении Лены по изучению морфологии и экологии муксуна в последние 20 лет не проводились, в связи с чем остро стоит вопрос об изучении современного состояния популяций четырех форм муксуна, о степени их дифференциации, экологических особенностях численности, взаимоотношениях между собой. Муксун заселяет все реки Якутии, но особенно многочисленен в дельте реки Лены. Наряду с ряпушкой и омулем, всегда является основным объектом.
Сибирская ряпушка-типичная полупроходная рыба. Выдерживает значительную соленость, широко использует кормовые запасы опресненной части морского шельфа и для размножения заходит в реку.
Ледовитоморской омуль с 8-го года жизни по достижению половой зрелости, омуль начинает входить в Лену. Начало хода приходится на начало июня окончание в августе. В районе Вилюя омуль появляется в середине сентября, участок реки Лены у города Якутска проходит в конце сентября начале октября. Прослежен до Олекминска.