В природе свободный водород встречается крайне редко, именно в газах фумаролл в Исландии, в Тоскане. В виде соединений водород очень распространен. Он составляет 1/9 ч. по весу воды; вместе с углеродом, азотом и кислородом он является непременною составною частью всего организованного.
В природе водород распространен в виде высшего оксида – воды, а вода бывает нескольких «видов», обычная или протиевая – Н2О, тяжелая или дейтериевая – D2O, и сверхтяжелая или тритиевая – Т2О, но её в природе почти нет.