Родился Базаров в семье полковоголекаря Василия Базарова и дворянки Арины Власьевны, выучился в университете на доктора (пойдя по стопам отца). В университете Базаров познакомился и подружился с Аркадием Николаевичем Кирсановым. Вскоре они вместе поехали в имение Кирсановых. Там Базаров познакомился с отцом Аркадия Николаем Петровичем и дядей Павлом Петровичем. Конфликтовал с Павлом Петровичем из-за отличий во взглядах на жизнь.
Затем Базаров влюбляется в Анну Сергеевну Одинцову. Любовь к ней коренным образом меняет выраженность нигилизма у Евгения — он «уверовал» в любовь. После этого Базаров едет к своим родителям, вместе с Аркадием. Побыв у них три дня, Базаров и Аркадий вновь возвращаются к Кирсановым, где первый заигрывает с Фенечкой, затем стреляется на дуэли с Павлом Петровичем Кирсановым.
Базаров едет к отцу, где начинает лечить всех, кто нуждается в помощи врача. В итоге, практикуясь на трупетифозного больного, Базаров поранил себе палец и получил заражение крови, в результате чего умер.