Сами молекулы не изменились. Как были Н2О, так и остались Н2О.
Расположение молекул изменилось. Расстояние между молекулами пара стало значительно больше размеров одной молекулы. А в воде молекулы расположены почти вплотную.
Движение молекул изменилось. Молекулы пара движутся беспорядоченно по всем направлениям, почти не притягиваясь друг к другу. Молекулы же воды "топчутся" на месте, иногда совершая перескоки в ту или другую сторону.