1) На деревьях стали появляться почки и листья, потому что наступила весна. (подчинительная связь)
2) Хмурились тучи, море грозно шумело и буйствовало. (сочинительная связь)
3) Когда папа вернулся с работы, мама уже приготовила ему ужин. (подчинительная)