Самая главная причина это монгольские завоевания.
В 1219 году Чингизхан лично выступил в поход со всеми своими сыновьями и с главными военными силами. Армия завоевателя была разделена на несколько частей. Одной командовали его сыновья Чагатай и Угэдэй, оставленные отцом осаждать Отрар.
Осада Отрара продолжалась около пяти месяцев. . Предательство одного из военачальников ускорило падение Отрара. Монголы убили всех жителей Отрара.