Главным постулатом Римского консенсуса II является определение функциональных заболеваний желудочно-кишечного тракта (ЖКТ), которые характеризуются как "... вариабельная комбинация хронических или рецидивирующих симптомов, не объясняемых структурными или биохимическими изменениями...", т.е. функциональные расстройства не включают в себя хорошо известные расстройства, в своей основе являющиеся вторичными по отношению к структурной базе или заболеваниям нервной системы.
До недавнего времени знание патофизиологии этих симптомов было ограничено, как следствие этого отсутствовали методы диагностики нарушений функций, и к диагнозу "функциональное нарушение" врач приходил после исключения органических заболеваний.
В настоящее время появились методы оценки нарушений функции органов, которые из разряда исследовательских перешли в разряд диагностических. В частности, речь идет об исследовании висцеральной чувствительности пищеварительного тракта с помощью баростата, мониторирования моторики ЖКТ, позитронно-эмиссионной томографии (ПЭТ) и функциональной магнитно-резонансной томографии (ФМРТ).
У значительного числа врачей существует сомнение относительно легитимности такого подхода к диагностике, поскольку мировоззрение большинства из них формируется и продолжает формироваться на основе философских взглядов о первичности нарушений "структуры" и вторичности "функции". Основой такого подхода является постулат, что приматом какого-либо заболевания всегда является идентифицированное нарушение структуры, приводящее к нарушению функции органов и тканей или их биохимических составляющих, которые в свою очередь находятся в линейной связи с восприятием пациентами измененного здоровья – своей болезни. Эта концепция в течение всего прошлого века поддерживалась диагностическими подходами, включая анализ данных гистологии, эндоскопии и радиологических исследований, а в последние годы – и молекулярно-генетических маркеров патологического процесса.
Однако эта точка зрения не дает понимания истинной природы заболеваний вообще и болезней ЖКТ в частности, поскольку не учитывает восприятия своей болезни самим человеком. Между тем на практике мы нередко видим отсутствие корреляций между восприятием болезни пациентом и эндоскопическими, морфологическими и другими критериями патологии даже при таких "структурных" расстройствах, каковыми являются воспалительные или даже опухолевые заболевания ЖКТ.