Елена Гаджиевна Исинбаева появилась на свет 3 июня 1982 года в Волгограде. Отец будущей спортсменки Гаджи Гафанович эмигрировал из Дагестана и работал сантехником, мать Наталья Петровна - коренная русская, работала в котельной, позже стала домохозяйкой.
Семья жила скромно и небогато, хотя чета Исинбаевых поддерживала Елену и её младшую сестру Инессу во всех начинаниях. Мать воспитывала девочек в строгости и прочила им спортивную карьеру, так как сама в детстве увлекалась баскетболом и пыталась поступить в институт физкультуры.В пятилетнем возрасте Елена пошла в спортшколу, где занималась художественной гимнастикой под руководством супругов Лисовых, заслуженных тренеров России. В 1989 году Исинбаева поступила в лицей инженерно-технической направленности, где отучилась 10 классов. Девочка обучалась в специальном училище олимпийского резерва в и 2000 году без конкурса поступила в Волгоградскую Академию физической культуры.
В 2003 году Елену Исинбаеву призвали на службу в железнодорожные войска, и через два года девушка получила звание старшего лейтенанта, а еще через три - капитана. В 2015 году спортсменка получила звание майора и подписала контракт с Министерством обороны России, согласно которому Исинбаева будет проводить инструктаж в военном училище.