В начале развития пыльцевого зерна ядра вегетативной и генеративной клеток лежат рядом и по размерам, кроме ядрышек, не отличаются друг от друга. Объем ядрышка в ядре вегетативной клетки несколько больше, чем в генеративной. Эти клетки различаются ядерно-плазменными отношениями. В цитоплазме вегетативной клетки пыльцевого зерна пшеницы имеются амилопласты с крахмалом, число разнообразных по форме митохондрий увеличивается, меняется их морфология. Встречаются и другие органеллы и структуры. Аппарат Гольджи представлен 4—6 параллельными цистернами и мелкими пузырьками. По сравнению с микроспорами он малоактивен. Характерная особенность данной стадии развития пыльцевого зерна — быстрый рост органелл и их связь с ЭР. Помимо органелл в цитоплазме содержатся осмиофильные образования, лизосомоподобные структуры. Оболочка ядра вегетативной клетки имеет многочисленные поры, связь с ЭР наблюдается редко. На этой стадии развития интина окончательно сформирована, плазмалемма образует в ее сторону глубокие инвагинации.