Проверочное слово к слову стаЯми
проверочное слово групами
Стая.....................
В слове стаями буква Я не провертеться стаЯМИ это окончание. Проверяем: стаЯМИ - стаЕЙ- стаИ и так далее
А мне кажется окончание-И