Подготовительный этап (1 стадия) протекает у одноклеточных в лизосомах,у многоклеточных в пищеварительном тракте.
Бескислородный этап (2 стадия) протекает в цитоплазме.
Кислородный этап (3 стадия) протекает в матриксе и на внутренней стороне митохондрии.