Первым шагом на пути к возникновению многоклеточного организма явилось образование колониальных форм. Такой процесс тоже характерен для жгутиковых, у которых образование колоний происходит за счет того, что клетки, образующиеся в результате деления, не расходятся, а остаются соединенными. Примером могут служить микроскопические колониальные жгутиковые, состоящие из 16 (пандорина) или 32 (эудорина) одинаковых клеток. В этих случаях каждая клетка питается самостоятельно, причем процесс пищеварения типичный внутриклеточный.