Происхождение Титикаки довольно интересное: учёные считают, что более 100 млн. лет назад этот водоём находился на уровне Мирового океана и был заливом – этот факт подтверждают склоны гор, на которых геологи обнаружили следы морского прибоя, а также окаменелые остатки морских животных, обнаруженных на побережье.