У губок хорошо развита пассивная защита,например выделение запаха,отпугивающий многих животных. Наличие в теле большого количества минеральных игл также спасает губок о многих хищников.
Несмотря на все защитные приспособления губок, их в большом колличестве поедают морские звезды, некоторые рыбы и другие водные беспозвоночные и позвоночные животные.
Помимо того что губки служат пищей другим животным, они еще и прекрасная среда обитания для мелких паразитических ракообразных и червей, которые паразитируют в них.
Некоторых губок, например бадягу пресноводную и губку туалетную, активно собирает человек. Их используют в медицинской и парфюмерной промышленности, для технических целей и в качестве удобрения.