Это связано с вакуолями. В частности с фагосомами и лизосомами, которые необходимы для избавления клетки от чужеродных обьектов (например, для разрушения и элиминации бактерий).
Строение и функции фагосом и лизосом в полном обьеме описаны на википедии.