Многоклеточные водоросли состоят из таллома (слоевища) - слоя клеток, не дифференцированного на ткани и органы. Мхи же имеют дифференциацию на органы: они имеют коробочки на ножках, несколько слоёв клеток, каждый из которых дифференцирован по функциям. Так же фотосинтез у водорослей происходит в хроматофорах, а у мхов в хлоропластах. В цикле развития многоклеточных водорослей доминирует спорофит, а у мхов - только гаметофит. Схожи они тем, что впитывают питательные вещества всей поверхностью тела, а так же имеют ризоиды, выполняющие функцию прикрепления растения к субстрату.