Функция самая обычная -защитная. Для защиты от внешних физических и инвазионных воздействий.
Покровные ткани обычные, образованная верхним ороговевшим и нижним слоями, но у большинства рыб они имеют чешуйные карманы. А вот там уже есть чешуя трех основных типов - циклоидная, ктеноидная и плакоидная. Первые две встречаются у большинства рыб и образованы склеритами (тонкие костные пластинки) , которые образуются в течении всей жизни. Плакоидная, схожая по строению с зубными тканями, встречается у хрящевых рыб.
Есть еще один более древний вид чешуи - ганоидная, свойственная кистеперым и двоякодышащим.
У ряда видов кожа голая, чешуи разбросаны редко по телу или полностью отсутствуют, а ее функции выполняют плотные костные пластинки. У придонных видов не имеющих чешуи кожные покровы более плотные и выделяют большое количество слизи, что также имеет защитные функции.