Для начала и то и другое - микроскопические зеленые водоросли.
Также сходны тем. что широко распространены в пресных водах. Большая часть представителей является пресноводными.
Различия: Хламидомонады - одноклеточные водоросли. Спирогира - нитчатая водоросль, состоящая из ряда цилиндрических клеток. У них различны жизненные циклы, состав и особенности размножения.
У Спирогиры Размножение вегетативное (делением клеток) или половое (конъюгация) . При конъюгации клетки двух соседних разнознаковых («+» или «-») нитей соединяются между собой боковыми выростами, образуется копуляционный канал, по которому протопласт одной клетки перетекает в другую и сливается с содержимым последней. Клетка, в которой произошло слияние (зигота) , закругляется, отделяется от нити и, одеваясь толстой оболочкой, превращается в зигоспору. Зигоспора перезимовывает и весной проходит мейоз, давая 4 споры, три из которых отмирают, а одна прорастает в молодую нить («+» или «-»). Все стадии, кроме зиготы и зигоспоры, — гаплоидны.
Представители рода Хламидомонады (Chlamydomonas), имеют сложный жизненный цикл. Гаплоидные вегетативные клетки размножаются митозом. В условиях недостатка питательных веществ (например, азота) они многократно делятся митозом, образуя половые клетки — гаметы. Затем разнородные гаметы попарно сливаются, образуя диплоидные зиготы. Зигота окружена плотной клеточной стенкой, что позволяет пережить неблагоприятное время. При наступлении благоприятных для жизни условий зитога делится мейозом на 4 гаплоидные вегетативные клетки.