Несмотря на шторм,1 корабли были вынуждены продолжать свой путь,2 лежавший на запад,3 и вскоре затерялись в беспредельном пространстве бушевавшего со вчерашнего дня моря.
1-я запятая: обособляет оборот со знач. уступки
2-я и 3-я - причастный оборот после определяемого слова