На долю промышленного комплекса приходится 74 % от суммарного объема ВРП региона. Этот сектор отличается четко выраженной специализацией. Отсюда поставляется большая часть топлива (угля, нефти и газа) в остальные регионы. Хозяйство Западной Сибири немыслимо без электроэнергетики, нефтехимической и химической промышленности, машиностроения. Все они тесно связаны с топливной добычей. Химический комплекс представлен предприятиями Тобольска, Томска и Омска, а также Кемеровской области. Машиностроительные заводы выпускают продукцию для энергетического комплекса, для угольной промышленности и станкостроения. Несмотря на уникальность своей структуры, хозяйство Западной Сибири понесло значительные потери в 90-е годы. Промышленная продукция снизилась почти вдвое. Около 30% приходится сейчас на грузооборот автотранспорта. 65 % дореформенного уровня занимает сельское хозяйство Западной Сибири.