Мексиканское нагорье характеризуется своеобразной богатой растительностью (более 8 тыс. эндемичных видов). На севере растительность редкая, представленная многими видами кактусов (около 500 видов), агавами (140 видов), юкками, дазилирионами и колючими кустарниками. К югу растительность сменяется саваннами, в которых растут злаковые, амарантовые, редкие акации и другие виды. На наветренных склонах южной части нагорья растут влажные тропические леса.