Заповедник был создан 11 января 1917 для сохранения популяции соболя и носил название "Баргузинский соболиный заповедник". В период основания в заповеднике насчитывалось не более 30 соболей. На данный период времени Баргузинский заповедник является комплексным и носит название " Баргузинский государственный природный биосверный заповедник". Численность соболей значительно увеличилась и теперь на 1 метр заповедника приводится около особей животного.√