Начальная форма - кто-то (оно же неопределенное) . Если бы оно было в другом падеже (кого-то) , какую начальную форму вы бы написали? Правильно, кто-то. Начальная форма - это же просто И. падеж ед. ч.
кто - это другое разряд: вопросительное - относительное.
Если бы вам нужно было найти, от какого слова образовалось КТО-ТО, тогда, конечно, от слова КТО с помощью суф. -ТО (суф. способ образования).