1. Болотник Верещагина – редкий, эндемичный вид
2. Лук дернистый – редчайший, узкоэндемичный, находится под угрозой исчезновения
2. Лук мелкосетчатый (черемша) – редкий вид
3. Лук многокорневой – редкий вид
4. Рябчик бледноцветный – редкий, эндемичный вид
5. Тюльпан разнолепестной – редкий вид
6. Кандык сибирский – редкий, сокращающий ареал вид
7. Ирис Людвига – редкий, узкоэдемичный
8. Башмачок крупноцветный - редкий, сокращающий ареал вид
9. Башмачок настоящий – редкий, сокращающий ареал вид
10. Башмачок пятнистый – редкий, сокращающийся ареал вид
11. Ятрышник шлемовидный – редкий вид, с уменьшающийся численностью
12. Ревень алтайский – редкий вид, с сокращающимся ареалом
13. Кувшинка белая – редкий вид
14. Пион степной – эндемичный вид, с сокращающимся ареалом
15. Живокость саурская – редкий, узкоэндемичный вид
16. Адонис весенний – редкий вид
17. Гимноспермиум алтайский – редкий вид, во многих местах исчезающий
18. Долгоног снеговой – редкий вид, реликтовый вид
19. Голоплодник бесстебельный – редкий, эндемичный вид
20. Строгановия стрелолистая – очень редкий, эндемичный реликтовый вид
21. Родиола розовая – ценный вид – ценный вид, с сильно сокращающейся численностью
22. Сибирка алтайская – редкий вид, с уменьшающийся численностью
23. Яблоня Сиверса – вид с сильно сокращающийся численностью
24. Шиповник Павлова – редкий, эндемичный вид
25. Миндаль Ледебуровский – редкий, эндемичный вид
26. Майкарагана Ховена – редкий, эндемичный, реликтовый вид
27. Астрагал беловойлочный – эндемик Зайсанской котловины
28. Астрагал сладколистый – редкий, реликтовый вид
29. Астрагал тонкостебельный – редкий, эндемичный вид
30. Остролодочник иглистый – очень редкий, эндемичный вид
31. Копеечник прутьевидный – очень редкий вид
32. Сочевичник Ледебура – редкий, эндемичный вид
33. Волчеягодник алтайский – редкий, эндемичный, реликтовый вид
34. Стеллеропсис тарбагатайский – редкий, эндемичный вид
35. Водяной орех - редкий, реликтовый вид с сокращающимся ареалом
36. Подлесник европейский - редкий, реликтовый вид
37. Осмориза остистая – очень редкий, реликтовый вид
38. Ледебуриелла жабрицевидная – редкий, эндемичный вид
39. Кучкоцветник Мейра – редкий вид с малой численностью
40. Багульник болотный – редкий вид
41. Толокнянка обыкновенная – редкий вид
42. Клюква мелкоплодная – редкий вид
43. Акантолимон тарбагатайский – редкий, узкоэндемичный вид
44. Кермек Резниченко – редкий, реликтовый, эндемичный вид
45. Мертензия Попова - редкий, эндемичный вид
46. Мертензия тарбагатайская – очень редкий, узкоэндемичный вид
47. Черноплодник ежистый – редкий узкоэдемичный вид
48. Мытник тарбагатайский – редкий, узкоэндемичный вид
49. Марена резниченковская – редкий, узкоэндемичный вид
50. Цимбария даурская – редкий вид
51. Пиретрум Келлера – редкий, узкоэндемичный, реликтовый вид
52. Мордовник зайсанский - редкий узкоэндемичный вид
53. Рапонтикум сафроловидный (маралий корень) – вид с сильно сокращающейся численностью
54. Плаун баранец – очень редкий вид
55. Полипорус корнелюбивый – редкий вид
56. Кладина оленья (ягель) – редкий вид лишайника