Самое важное отличие - это, пожалуй, тот факт, что у голосеменных эндосперм(питательная ткань) образуется ДО оплодотворения, а у покрытосеменных - после, т.к. у них двойное оплодотворение(один спермий оплодотворяет гаплоидную яйцеклетку(образ. диплоидный зародыш семени), а другой - центральную диплоидную клетку(образ. триплоидный эндосперм))