Основная часть суши лежит на полуострове Ютландия; Дании также принадлежат многочисленные острова, среди которых — часть Северо-Фризских островов, острова Борнхольм, Фюн, Фальстер, Лолланн, Зеландия и другие. Гренландия и Фарерские острова входят в состав Дании чисто формально.
Площадь страны составляет 43 тысячи 376 км², из них 667 км² приходится на внутренние воды. Дания имеет сухопутную границу с Германией протяжённостью 68 км.
Рельеф страны в основном равнинный, однако есть и холмы, оставленные ледниками. Здесь много озер и рек, но последние довольно мелководные. Часть территорий находится в зоне возможного затопления с моря, поэтому для защиты поселений и сельскохозяйственных угодий там поставлены дамбы.