Главные притоки Нижней Тунгуски: справа — Ейка, Кочечум, Ямбукан, Виви, Тутончана, Ерачимо, Северная; слева — Непа, Большая Ерёма, Тетея, Илимпея, Нидым, Таймура, Учами. Основным притоком Нижней Тунгуски является р. Кочечум со среднегодовым расходом воды в устье 600 м³/с и площадью бассейна около 100 тыс. км².[8]