Световая микроскопия тесно связаны с цитологией - наука о клетках. С помощью светового микроскопа можно увеличить клетку до 264 раз. Проще всего наблюдать за окрашенной клеткой шелухи луковицы - её клетки большого размера. Но, в целом, микроскопия работает с более мелкими экземплярами. Иногда увеличения светового микроскопа может быть недостаточно. Тогда используют световой микроскоп. Он увеличивает клетки в сотни раз больше, чем световой. С его помощью можно различать органы клетки, и протекающие в неё реакции. Но у такого микроскопа есть минус - изображение фиксируется, наблюдать в режиме реального времени нельзя.