Различия в стебле: У хвощей -жёсткий прямостоячий.У плаунов - либо стелющийся,либо прямостоячий и мягкий
Различия в листьях:У хвощей мелкие чешуевидные. У плаунов бывают самой разной формы
Различия в побеге:У хвощей побег только весенний и летний побеги.У плаунов- такого деления нет
Различия в корнях:У хвоей есть корневище и отходящие от него придаточные корни.У плаунов придаточные корни,отходящие от стелющейся части побега
Различие в размножении:У плауна гаметофит чаще всего подземный и питание у него сапрофитное. У хвоща гаметофит все же более взрачный(маленький и зелёный).Так же плауны чаще всего обоеполые,в отличии от хвощей.
Удачи!!!