В 1935 году митрополит Андрей Шептицкий назначил Слипого соборным крылошанином Архикафедрального собора святого Юра и архидьяконом Львовской митрополичей капитулы. 25 ноября 1939 года папа римский Пий XII по просьбе тогдашнего предстоятеля УГКЦ Андрея Шептицкого назначил Иосифа Слипого коадъютором (преемником) митрополита, и 22 декабря 1939 года Шептицкий в строгой тайне рукоположил Иосифа в епископы с правом преемничества. Активно сотрудничал с немецкими оккупационными властями (в частности, при формировании дивизии СС «Галичина»)