У той же день був узятий Франкенгауз. Поранений в голову Мюнцер потрапив в полон. Після болісних тортур його відправили в замок Хельдрунген і знову катували, переконуючи відректися від своїх єретичних помилок. Не відомо наскільки кати досягли успіху в цьому. 27 травня 1525 року вождь плебейської Реформації був страчений. З ним разом стратили Пфейфера і ще 25 невідомих людей.