При процессе горения выделяются различные вещества, в том числе углерод. Сажа - то, что образуется на стекле, она и состоит из углерода.
Верхняя часть свечи более горячая, т.к пламя выделяет большое кол-во теплоты, которое нагревает ее постепенно с верху в низ.
( Если точнее, то атомы при горении начинают двигаться хаотично и гораздо быстрее, чем до горения. Они толкают атомы, находящиеся рядом, приводя их в равное по скорости движение. При движении атомы сталкиваются, нагреваясь как следствие. Вся свеча не нагревается до температуры около огня т.к. источник быстрого движения атомов ( огонь ) не может передавать это движение на n расстояния от себя. Т.е атомы в далеке от огня не поддаются нагреванию и тормозятся при столкновении и другими атомами, их ничего не приводит в движение, поэтому нагрев дальше не идет).