Географическим ориентиром района была и остаётся величайшая река мира – Обь. Её среднее течение, а это 275 км, приходится на территорию района.
По площади бассейна река Обь занимает пятое место на планете. Около г. Сургута река разделяется на два рукава: главную и Юганскую Обь, в которые впадают притоки: Кульеган, Большой Юган, Лямин, Пим, Тромъ-Еган.
Крупнейшим озером на территории района являются: Пильтанлор (98,8 кв. км) .
Приустьевые участки рек: Тром-Аган, Большой Юган, Лямин и Пим – являются самыми пониженными частями территории. Большая её часть занята болотами, где в основном преобладают подзолистые, торфяно-подзолистые, торфяно-болотные почвы.