Всё вещество головного мозга представлено клетками - нейронами. Серое вещество - тела нейронов, белое вещество - пучки отростков (аксонов), покрытых миелином. По отросткам в разные отделы мозга приходят и уходят импульсы. Импульс может переходить по такой схеме: отросток 1-го нейрона - тело 1-го нейрона - отросток 2-го нейрона - тело 2-го нейрона и т.д. Соответственно, тела нейронов могут находится в разных отделах мозга.
Отделы мозга со спинномозговой жидкостью импульсами не обмениваются и напрямую не связаны. Если рассматривать строение мозга в целом, то в головном мозге располагаются несколько пустот - желудочки мозга, которые связаны между собой и спинномозговым каналом и омываются изнутри спинномозговой жидкостью.