Потому, что автотрофами называют только тех, кто питается неорганическими веществами, да еще и используя солнечный свет в большинстве случаев. А как мы знаем из школьного курса - органические вещества значительно разнообразнее неорганических, да еще и по разному растут, бегают и летают. Боэтому большее разнообразие приходится на гетеротрофов, что среди бактерий, что среди многоклеточных организмов.