Поліпептиди можуть захищати від різних впливів: хімічних, фізичних, біологічних. Наприклад, якщо організму загрожує небезпека у вигляді вірусу або бактерії, що мають чужорідну природу, то імуноглобуліни (антитіла) вступають з ними "в бій", Виконуючи захисну роль.
Якщо говорити про фізичних впливах, то тут велику роль відіграють, наприклад, фібрин і фібриноген, які беруть участь в згортанні крові.